Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms