Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms