Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PFKFB3Q16875 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFKFB3Q16875 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms