Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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RTN1Q16799 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTN1Q16799 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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