Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms