Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIK4Q16099 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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