Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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