Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZFHX3Q15911 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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