Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCOA1Q15788 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCOA1Q15788 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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