Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
EFNB3Q15768 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms