Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NCF4Q15080 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NCF4Q15080 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NCF4Q15080 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NCF4Q15080 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NCF4Q15080 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NCF4Q15080 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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