Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
R3HDM1Q15032 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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