Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms