Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HNF4GQ14541 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms