Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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