Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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