Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCLQ13371 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms