Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGB3BPQ13352 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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