Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FOXI1Q12951 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms