Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRJQ12913 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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