Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
STX4Q12846 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
STX4Q12846 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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STX4Q12846 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STX4Q12846 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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