Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CGNL1Q0VF96 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms