Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPAL4Q0D2K0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms