Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABPAQ06546 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms