Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GBE1Q04446 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms