Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERCC6Q03468 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms