Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUD4Q01804 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms