Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLK1P49759 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLK1P49759 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLK1P49759 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms