Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FNTAP49354 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FNTAP49354 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms