Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX11P35716 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX11P35716 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX11P35716 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX11P35716 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX11P35716 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX11P35716 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX11P35716 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX11P35716 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX11P35716 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX11P35716 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX11P35716 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms