Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-FP30511 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms