Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ALDH4A1P30038 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms