Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HTR1EP28566 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR1EP28566 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR1EP28566 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR1EP28566 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR1EP28566 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR1EP28566 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HTR1EP28566 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms