Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5A1P25705 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5A1P25705 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5A1P25705 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5A1P25705 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5A1P25705 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5A1P25705 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5A1P25705 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5A1P25705 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms