Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRPH2P23942 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms