Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VAMP1P23763 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms