Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1BP22528 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1BP22528 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms