Protein–RNA interactions for Protein: P21964

COMT, Catechol O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTP21964 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMTP21964 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMTP21964 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMTP21964 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMTP21964 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMTP21964 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMTP21964 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMTP21964 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMTP21964 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COMTP21964 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COMTP21964 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COMTP21964 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMTP21964 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMTP21964 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMTP21964 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMTP21964 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
COMTP21964 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMTP21964 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMTP21964 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMTP21964 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COMTP21964 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms