Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA1P20827 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms