Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NELFEP18615 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NELFEP18615 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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