Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MTHFD2P13995 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms