Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA4P13612 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms