Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGAMP11215 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms