Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD3P0DMS9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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