Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRCP08575 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRCP08575 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms