Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSLP07711 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSLP07711 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms