Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP9BO43861 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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