Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGSM2O43147 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGSM2O43147 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms