Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
CCDC179H3BU77 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms