Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MCRIP1C9JLW8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms